Творческое взаимодействие между НИИ ЦПК и МГУ насчитывает уже несколько десятилетий. Особенно эффективным оно было в период 1983-2003 гг., когда ученые Центра и Университета выполнили цикл интереснейших исследований с использованием уникального комплекса ЦФ-18. Полученные результаты не имели аналогов в мире и были высоко оценены как научным сообществом, так и государством. Объединенный коллектив ученых НИИ ЦПК и МГУ дважды удостаивался Государственных премий – СССР в 1989 г. и РФ в 2002 г.

В настоящее время предпринимаются усилия для придачи нового импульса научному сотрудничеству Центра и Университета. Начальником НИИ ЦПК им. Ю.А.Гагарина С.К.Крикалёвым и ректором МГУ им. М.В.Ломоносова В.А.Садовничим подписаны новое Соглашение о сотрудничестве и Программа совместных исследований.

Данными документами предусматривается проведение фундаментальных и прикладных исследований в интересах обеспечения пилотируемых полетов человека в дальний космос. В процессе предстоящих работ будут использоваться как моделирующие комплексы НИИ ЦПК, так и исследовательские стенды МГУ (например, уникальный панорамный стенд виртуальной реальности).

Новой составляющей сотрудничества Центра и Университета станет образовательная сфера.

Программа совместных исследований наполнена конкретным содержанием и предусматривает работы на период 2013-2015 гг.

Она включает подготовку и реализацию новых космических экспериментов, исследование возможностей создания и применения робототехнических систем для обеспечения эффективной и безопасной деятельности космонавтов на орбите Земли и планетах, экспериментальную отработку технологий сквозного моделирования пилотируемых миссий в дальний космос и др.

Особое место в рамках сотрудничества НИИ ЦПК и МГУ в научных и образовательных программах будет отведено участию молодежи.